三界在历经黑暗魔神一役后，安宁未持续太久。平静的灵界中，神秘的黑色雾气悄然蔓延，似有一双无形的手在拨弄着命运的齿轮。
在灵界一处隐秘之地，一位名为墨渊的黑袍神秘人现身。
他周身散发着诡异气息，双眸闪烁着幽光，喃喃自语道：“黑暗魔神虽灭，但其残魂碎片已被我收集，只要再集齐几样关键之物，我将成为比他更强大的存在，届时三界都将在我的掌控之下。”原来，他暗中窥探魔神之战，趁着混乱收集了残魂，意图掀起新的波澜。
天庭上，众仙正为和平庆祝，丝毫未察觉危机将至。杨戬却心生不安，那曾经与魔神战斗的天眼隐隐跳动，似在预警。他决定前往灵界查探，遂瞒着天庭众人，独自踏上征程。
与此同时，人间界的苏御在整理战后事宜时，发现一些士兵出现了异常。他们眼神呆滞，身体散发着若有若无的黑暗气息，且力量大增却失去了理智，开始攻击同伴。苏御意识到情况不妙，立即着手调查，发现这些士兵都曾在战场上接触过一种奇异的黑色粉末。顺着线索追寻，竟也指向了灵界。
灵山的高僧们在禅定中，感受到一股邪恶力量在暗处涌动，佛法的祥和之光也出现了微弱的波动。他们决定派出一位聪慧敏锐的年轻弟子慧空前往灵界探寻真相，以维护三界的和平。
杨戬率先抵达灵界，那熟悉的黑暗气息让他警惕起来。他小心翼翼地前行，却不知已踏入墨渊的陷阱。墨渊操控着黑暗残魂，化为幻影向杨戬发起攻击。杨戬施展神通，与幻影激战，却发现这些幻影竟能模仿他的招式，且越来越强，渐渐陷入困境。
慧空来到灵界后，凭借着佛法的感应，察觉到杨戬的危机。他迅速赶至，口诵经文，佛光绽放，驱散了部分黑暗幻影，与杨戬会合。二人交流后，决定共同寻找邪恶力量的源头。
苏御带领着一支精英小队随后也进入灵界，他们一路追踪黑色粉末的踪迹，终于与杨戬、慧空相遇。此时，墨渊现身，他身后是被黑暗力量控制的众多灵界生物，以及散发着浓烈黑暗气息的魔神残魂融合体。
墨渊发出狂妄的笑声：“你们以为打败了黑暗魔神就天下太平了？今日便是你们的末日，我将重塑三界秩序！”说罢，指挥着黑暗大军发动攻击。
杨戬、苏御和慧空立刻组织防御，双方展开一场激烈交锋。杨戬施展出法身，与黑暗生物厮杀；苏御指挥小队成员，运用元素之力对抗；慧空则以佛法净化着黑暗气息，保护众人免受邪恶力量侵蚀。然而，墨渊的力量不断增强，黑暗大军源源不断，联军渐渐不支。
关键时刻，慧空想起灵山古籍中的记载，有一种神秘的灵界圣物“净世白莲”，或许能克制这股黑暗力量。但圣物被强大的禁制守护，且位置隐秘。杨戬决定冒险一试，他独自突破墨渊的防线，向圣物所在之处奔去。
苏御和慧空则带领众人全力抵挡墨渊的攻击，为杨戬争取时间。杨戬在途中遭遇了重重阻碍，包括墨渊设置的机关陷阱和守护兽，但他凭借着坚韧的意志和强大的实力一一闯过。终于，他找到了“净世白莲”，但触动了周围的禁制，遭受了强大的能量冲击，身受重伤。
杨戬强忍着伤痛，带着“净世白莲”返回战场。慧空见状，立刻施展佛法护住白莲，并与苏御一同协助杨戬将白莲的力量激发出来。一道圣洁的光芒绽放，所到之处黑暗消散，被控制的灵界生物恢复了理智，墨渊的黑暗力量也被大幅削弱。
墨渊恼羞成怒，他不顾一切地将自身与魔神残魂完全融合，化为一个巨大的黑暗魔影，向联军发动最后的疯狂攻击。杨戬、苏御和慧空三人齐心协力，将各自的力量汇聚于“净世白莲”之上，向墨渊发动了致命一击。
光芒闪耀，墨渊发出凄厉的惨叫，他的身体逐渐瓦解，黑暗气息也被彻底净化。这场战斗终于落下帷幕，三界再次逃过一劫。
经此一役，三界更加深刻地认识到和平的来之不易。
天庭加强了对灵界的巡查与监管；灵山加大了佛法的传播与弘扬，提升众人的心境修为；人间界则进一步研究对抗黑暗力量的方法与技巧，提升自身实力。
而杨戬、苏御和慧空的英勇事迹也在三界传颂，成为了人们心中新的英雄典范，激励着无数人守护这来之不易的和平与安宁，同时也时刻警惕着未知的黑暗势力，为三界的未来而不懈努力。
数年后，三界看似一片繁荣景象。然而，在一次灵界的庆典上，意外发生了。天空突然变得阴暗，一道裂缝缓缓打开，从中涌出一群形似恶魔的生物。它们浑身燃烧着紫黑色火焰，口中喷出腐蚀性的毒液。
杨戬、苏御和慧空再度集结。杨戬皱眉道：“看来还有隐藏的黑暗力量。”慧空双手合十：“阿弥陀佛，此次怕是更为棘手。”苏御握紧武器：“不管怎样，我们绝不让三界重陷黑暗。”
他们冲向恶魔群，战斗瞬间爆发。可是这些恶魔极为难缠，每受一次伤便分裂出更多个体。
就在众人苦战之时，之前被净化的墨渊残魂突然出现，不过此时它的气息却纯净了许多。
墨渊残魂说道：“这是上次大战的余波引出的异空间生物，只有用特殊阵法才能封印。”说完便融入三人的力量之中，形成一道封印法阵。三人合力启动法阵，恶魔们被尽数吸入阵中，裂缝关闭。从此，他们再次成为守护三界的传奇，而三界也明白了危险永远潜伏，需时刻准备应对。
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