三界刚从暗影军团的肆虐下缓过劲来，残垣断壁间，重建的呼喊与灵力修复的光芒交织闪烁。杨戬等人深知，这场胜利只是险胜，若要长治久安，必须主动出击，探寻暗影根源，斩草除根。
杨戬站在灵霄宝殿之巅，目光穿透云层，望向宇宙深处：“此次暗影来势汹汹，背后定有主谋操控。我欲率一队精锐，循其来路探寻真相，彻底解决隐患。”苏御、灵儿、慧空高僧纷纷响应，愿一同前往。众人挑选出三界顶尖高手，组成“溯源远征军”，备好物资，踏上未知征途。
远征军踏入宇宙混沌，黑暗物质如浓稠墨汁，阻碍前行，方向难辨。幸有灵儿以混元灵珠感应灵力波动，勉强指引路径。行至一处神秘星云，这里电磁风暴肆虐，能量乱流纵横，舰队举步维艰。苏御挺身而出，双手舞动，以元素之力驯服乱流，开辟出一条安全通道。
待穿越星云，一座阴森诡异的“暗影魔窟”浮现眼前。其周身环绕紫黑色闪电，大门紧闭，符文闪烁，散发着令人胆寒的邪恶气息。杨戬祭出三尖两刃刀，刀光如虹，狠狠劈向大门，众人紧跟其后，闯入窟内。
窟内迷宫般曲折，暗影陷阱丛生。慧空高僧口诵佛号，以佛光驱散黑暗幻象，让众人保持清明。行至深处，见一黑袍暗影主宰端坐高堂，周身暗影能量翻涌，犹如实质。他见众人闯入，发出桀桀怪笑：“三界蝼蚁，竟敢擅闯吾地，今日便是你们的死期！”言罢，操控暗影卫士如潮水般涌来。
这些卫士身形飘忽，攻击刁钻，远征军一时陷入苦战。杨戬施展九转玄功，身形如电，在敌阵中杀得七进七出；苏御以元素之力变换攻防，或筑起冰墙抵挡，或引动火球反击；灵儿以灵源之力加持众人，提升灵力续航；慧空高僧则以佛力庇护，净化近身暗影。
激战正酣，远征军渐渐摸清卫士弱点，他们受暗影主宰精神控制，若切断控制链路，便可破其阵脚。杨戬与苏御对视一眼，心领神会。杨戬引开主力卫士，苏御剑指急点，元素之力化作利刃，斩断隐藏的控制丝线。卫士们瞬间陷入混乱，远征军趁机反攻，直逼暗影主宰。
暗影主宰恼羞成怒，倾尽魔力，释放出“暗影灭世波”，黑色能量如咆哮怒龙，扑向众人。关键时刻，灵儿飞身挡在前方，以混元灵珠全力抵挡，灵珠光芒黯淡，她口吐鲜血，却咬牙坚持。杨戬等人见状，怒从心头起，将所有力量汇聚，发出致命一击。
伴随着一声震天动地的惨叫，暗影主宰灰飞烟灭，魔窟剧烈颤抖，开始崩塌。众人不敢停留，迅速撤离。待返回三界，却发现家中也不安宁。
原来，远征军离开期间，三界部分地区出现“灵能异化”现象。一些修行者受残留暗影能量影响，灵力暴走，陷入癫狂，攻击同门、祸害百姓。杨戬心急如焚，与灵儿奔赴各地，以净化之力救治患者；苏御则着手研究对抗异化的方法，他从魔窟内带回的暗影样本中发现，可利用元素之力中和暗影能量，于是调配特殊药剂，辅助治疗。
慧空高僧在佛界开启法会，安抚受惊民众，引导众人以正念抵御恐惧。同时，为防止类似情况再次发生，他提议在三界设立“灵能净化司”，专门巡查、净化残留暗影能量，众人纷纷赞同。
经此一劫，三界反思自身防御短板，决定引入古老神秘的“星耀法阵”。此法阵需集齐三界特殊材料，依照星辰轨迹布置，一旦激活，能构建超强防御屏障，预警外敌入侵。杨戬、苏御、灵儿分赴各地，采集材料；慧空高僧则带领佛界众人，依据星图，推演法阵布局。
众人忙碌之际，又有消息传来：宇宙中一些中立势力，见三界连遭重创，心生觊觎，蠢蠢欲动，欲趁火打劫，抢夺资源。杨戬深知，攘外必先安内，当下加快法阵布置，同时派使者携带诚意前往中立势力，晓以利害，展示三界虽经磨难却不容小觑的实力。
使者不辱使命，部分中立势力被说服，愿与三界结盟，互通有无，共同抵御未知风险；仍有顽固势力不听劝阻，妄图偷袭。杨戬早有防备，在三界边境设伏，将来犯者打得落花流水，缴获大量物资，充实自身储备。
“星耀法阵”终于大功告成，激活瞬间，光芒耀天，笼罩三界。法阵内星辰闪耀，灵力流转，防御与预警功能完备。三界举行盛大庆典，庆祝重生。
庆典之上，年轻一辈修行者英姿勃发。他们在磨难中成长，技艺大增，纷纷展示成果：仙界少年研发出可便携追踪暗影能量的法宝；妖界少女培育出能净化空气、驱散暗影气息的灵植；人间才俊制造出灵力驱动的重建器械，效率极高。
杨戬等人望着朝气蓬勃的后起之秀，满心欣慰。他们知道，未来之路或许荆棘满途，但三界已铸就希望之基，只要团结一心，定能冲破黑暗，让曙光永照，续写传奇不朽。当夜幕降临，繁星点点，似为他们照亮前路，向着无尽未来，再次豪迈启程。
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