星门闭合后的第三个月，宝可梦联盟总部的警报系统突然发出刺耳的尖啸。正在研究维度结晶的冠军学员被沙奈朵的超能力托至半空，才勉强避开地面突然裂开的黑色裂隙。
“这是……暗蚀能量！”神秘人从传送门赶来，法杖顶端的水晶闪烁着警示红光，“和我们在星门深处看到的暗灵教团核心能源同出一源！”
全息投影突然启动，幻梦之境的长老影像出现在裂隙上方：“冠军学员，我们监测到第Ω-7宇宙的时空锚点正在崩塌。那里的暗灵教团余孽窃取了星门残留能量，企图用‘湮灭核心’重塑宇宙！”
冠军学员迅速穿上特制的维度防护服：“沙奈朵，启动阿尔宙斯共鸣模式；神秘人，准备时空稳定器。这次我们要彻底切断暗灵教团的跨维度联系！”
三人组通过裂隙的瞬间，被眼前的景象震惊——整个城市悬浮在破碎的星轨之上，建筑表面覆盖着暗金色的腐蚀纹路，宝可梦们在半空痛苦挣扎，它们的身体正逐渐透明化。
“那是……时空溶解现象！”联盟科学家的声音从耳麦传来，“湮灭核心正在抽取宇宙的时空能量，预计23分钟后整个宇宙将进入不可逆的坍缩！”
沙奈朵的mega石突然发出十二色光芒，她的超能力场扩展至整个城市。在精神感知中，冠军学员看到暗灵教团的教主正站在一座倒悬的金字塔顶端，他的心脏位置嵌着跳动的黑色核心，无数能量管线连接着城市各处的能量节点。
“沙奈朵，用全能场域稳定时空；神秘人，破解金字塔的防御系统；我去阻止教主！”冠军学员的指令刚落，一只全身由齿轮构成的宝可梦突然从地底钻出。
“这是……钢系传说宝可梦齿轮神！”神秘人认出图鉴中的记载，“它守护着宇宙的时空秩序，但现在被暗蚀能量污染了！”
齿轮神转动着身体，数百枚齿轮高速旋转，释放出切割时空的利刃。冠军学员指挥喷火龙mega进化，炽热的火焰与齿轮风暴在空中碰撞，爆发出刺眼的光芒。
沙奈朵趁机接近金字塔，她的超能力与塔基的古代符文产生共鸣。突然，金字塔表面浮现出十二道试炼之门，每道门前都站着一只属性克制的宝可梦——这是暗灵教团为阻止闯入者设下的终极防线。
“沙奈朵，同时激活十二属性共鸣！”冠军学员通过心灵感应传递战术，“用阿尔宙斯的全能形态破除属性克制！”
沙奈朵的mega形态首次显化出十二种属性的特征：头部生长出火焰鬃毛，背部浮现出水纹鳞甲，西肢缠绕着雷电之环。当她同时释放十二种属性技能时，试炼之门轰然倒塌，金字塔内部的能量核心暴露在众人眼前。
此时，冠军学员正与齿轮神进行着殊死搏斗。他发现这只传说宝可梦的弱点在于能量核心的位置——每当齿轮神发动全力攻击时，胸前的金色齿轮会短暂停止转动。
“喷火龙，抓住它停顿的瞬间，用神圣之火焚烧核心！”
喷火龙发出一声龙吟，全身包裹着净化之火，精准地击中齿轮神的能量核心。金色齿轮在火焰中熔化，齿轮神发出悲怆的轰鸣，身体逐渐恢复成普通形态。
“做得好！”神秘人通过传送门送来时空稳定器，“快把它安装在金字塔顶端，我需要三分钟重启Ω-7宇宙的时空锚点！”
冠军学员抱着稳定器冲向金字塔顶部，途中遭遇暗灵教团的精英成员。这些教徒的身体己部分暗蚀化，他们指挥着融合了虚空种基因的宝可梦发起自杀式攻击。
“沙奈朵，用精神强念开辟通道！”
沙奈朵的超能力化作十二道光束，将敌人一一击退。在她的掩护下，冠军学员成功抵达塔顶，将稳定器嵌入暗金色的祭坛。
“启动稳定器需要消耗整个宇宙的剩余能量，你们会被永远困在这里！”教主疯狂地大笑，“我要让你们亲眼看着这个宇宙在你们眼前毁灭！”
冠军学员不为所动，他将联盟勋章插入祭坛：“阿尔宙斯的意志不会允许宇宙毁灭。沙奈朵，将你的全能场域与稳定器同步！”
沙奈朵的超能力与稳定器产生共振，整个金字塔被神圣的光芒笼罩。在光芒中，冠军学员看到了Ω-7宇宙的历史：曾经这里的人类与宝可梦和谐共处，首到暗灵教团的出现，他们用星门能量制造出湮灭核心，妄图成为宇宙的主宰。
“你们的失败，是因为不懂得羁绊的力量。”冠军学员将圣物辉之宝玉嵌入祭坛，“现在，就让这个宇宙在希望中重生吧！”
随着宝玉的嵌入，整个Ω-7宇宙开始逆向坍缩。在坍缩的过程中，冠军学员、沙奈朵和神秘人看到无数个时间线在眼前闪过——有的时间线中，他们成功阻止了湮灭核心；有的时间线中，宇宙彻底毁灭；还有的时间线中，暗灵教团统治了整个多元宇宙。
当坍缩到奇点的瞬间，阿尔宙斯的幻象出现在众人面前：“你们的选择将决定Ω-7宇宙的未来。是让它在虚无中重生，还是保留所有时间线的记忆？”
冠军学员毫不犹豫地选择了后者：“每个时间线的宝可梦和人类都有存在的价值，我们不能剥夺他们的未来。”
阿尔宙斯赞许地点头，它的神格碎片融入稳定器，将Ω-7宇宙重塑成一个包含所有时间线的“多元共存体”。在新宇宙中，暗灵教团的威胁被消除，但保留了他们曾经存在的记忆，以此警示后人。
任务完成后，冠军学员等人回到主宇宙。在联盟总部的庆功宴上，幻梦之境的长老带来了新的情报：“我们在星门残留能量中检测到一股熟悉的波动——那是暗灵教团初代教主的灵魂印记。他似乎在寻找某个关键人物，而所有线索都指向……”
长老的话还未说完，沙奈朵突然发出警示的鸣叫。她的超能力感知到，在宝可梦学院的天文塔顶端，一个熟悉的身影正凝视着星空——那是曾经在星门深处看到的神秘人，他的手中握着一个跳动的黑色心脏。
“看来，我们的冒险还远未结束。”冠军学员握紧了联盟勋章，目光投向深邃的宇宙，“沙奈朵，准备好迎接下一次挑战了吗？”
沙奈朵微笑着点头，她的mega石再次闪烁起十二色光芒。在他们身后，多元宇宙研究局的新成员们正忙碌地分析着来自各个宇宙的情报，一场跨越维度的新征程即将开启。
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