随着神森城的陷落，以及本山家谱代重臣神森通茂的逃亡，使得长宗我部家再无肘腋之患。
加上先前本山茂辰在米田原之战中抛弃家臣、军势逃亡，以及在危难之际主动退往瓜生野城，抛弃了本山家的龙兴之地本山城，使得残存的本山家家臣们彻底对本山家失望。
而且，神森城陷落更成为压垮本山家的最后一根稻草。
屋所城、小仓山城、寺家城、大石城、古田城、井窪城、木能津城等北长冈郡诸多重镇要地纷纷慑于长宗我部家的军威而一矢不放的主动开城投降。这就使得吉良亲贞所率的长宗我部军主力在进入北长冈郡境内后，几乎是畅通无阻。同时，本山家的本据本山城也丧失了外围所有的屏障。
本山民部大辅、本山五郎右卫门、大窪勘十郎、河村四郎左卫门等本山家重臣们眼见本山城在长宗我部军兵临城下之前就陷入了孤立无援、内外交困的窘境，顿时丧失了战意，便先后劝说本山贞茂率剩余本山城城兵前去瓜生野城，与本山茂辰合流后从长计议。
自知无力抵御长宗我部家侵攻的本山贞茂在万般无奈之下，还是听从了家中重臣们的建议，在烧毁本山城中无法带走的粮草辎重后，便带着家眷以及仍忠于本山家的家臣、马廻众、治下领民等三百余人北上，前去与固守在瓜生野城的本山茂辰合流。
然而，吉良亲贞可不打算轻易放本山贞茂与本山茂辰合流，他当即率军对本山贞茂部展开追击。
终究本山贞茂所率的军势良莠不齐、成分复杂，且士气低落，哪里是气势如虹的长宗我部军的对手？
再加上，本山贞茂所部军势还拖家带口，并携带了一批粮草辎重，根本无法快速摆脱长宗我部军的追击。
就在本山贞茂部才渡过吉野川不久，不仅在宫之谷一带被长宗我部军追上，还被长宗我部军砍了个痛快，以至于整个宫之谷都布满了本山军的尸体，血流遍地，如同修罗场一般。
即便本山贞茂自己依靠个人勇猛，最后以一人一骑成功突出重围至瓜生野城，但其母冈丰御前与妹妹本山岑姬、本山萧姬等家眷皆被长宗我部军俘虏。至于本山民部大辅、本山五郎右卫门、大窪勘十郎、河村四郎左卫门等本山家重臣们也皆在混战之中被长宗我部军先后讨取。
随后，吉良亲贞更没有给本山家任何喘息的机会，在派遣久武亲信接管本山城后，就亲率两千余军势轻装疾进，直扑本山家治下最后的城池瓜生野城。
眼见长宗我部家正气势汹汹的大举北上，且家中更是众叛亲离，本就成了惊弓之鸟的本山茂辰哪里还有底气去继续与长宗我部家进行抗争？
于是，本山茂辰在经过一番权衡后，便决定放弃本领，逃往邻近的三好领境内，去寻求三好家的庇护和支持，以待有利时机出现后发起反攻。
但理想总是美好的，现实总是残酷的。
现如今，本山家早已人心尽失，加上宫之谷之战中连本山茂辰、本山贞茂父子的家眷都被长宗我部军俘获，几乎没有人愿意远离故乡继续追随本山茂辰、本山贞茂父子北上逃入三好领。甚至连本山家一门亲族众笔头本山茂定都开始心怀贰意了。
很快，本山茂定为了避免本山家家名断绝，以及自己不为本山茂辰、本山贞茂父子殉葬，便找上本山家马廻众之一的秦泉寺扫部助，并指示其煽动瓜生野城中对本山茂辰感到不满的城兵进行发难，意图趁着本山茂辰、本山贞茂父子不备之际将他们擒拿后献给吉良亲贞。
可本山贞茂并非只有一身蛮力，他也察觉到瓜生野城中气氛突变后，就劝说其父本山茂辰尽快逃离瓜生野城。
没曾想，本山茂辰还是对自己的叔叔本山茂定充满了信任，并没有听从本山贞茂的建议。
本山贞茂可不愿当阶下囚，眼见本山茂辰如此的冥顽不灵后，他直接带着弟弟本山茂庆、本山茂直等十余人一声不吭的缒城而下，逃出瓜生野城。在翻越玉取山、大森山、三之足山等险峻的山脉后，成功进入了三好家治下的阿波国三好郡境内。
只是，本山贞茂可没有受到想象中的欢迎，反而是被才继承大西家家名的大西赖晴（大西觉养之弟）当成了长宗我部家派来刺探情报的细作，差一点儿遭到处决。
若不是大西家重臣寺野源左卫门曾经担任过对本山家取次，恐怕本山贞茂、本山茂庆、本山茂直等一行人早就人头落地了。
即便本山贞茂、本山茂庆、本山茂直等一行人在寺野源左卫门的帮助下捡回一命，但依旧没有获得任何礼遇。
大西赖晴可不希望自己收容本山家余孽而遭到长宗我部家的侵攻。毕竟，大西家因出兵前往京都参阵，已经遭到了上杉家的重创。不仅前任家督大西觉养兵败身亡，就连随大西觉养一同渡海东去的一千余军势更是没有一人返回故乡。
最后，大西赖晴还是将本山贞茂、本山茂庆、本山茂直等一行人送往胜瑞城，交由三好家四国派重臣筱原长房来进行决断。
而另一方面，本山茂辰很快就为自己轻信本山茂定付出了代价。
本山茂定在获知本山贞茂、本山茂庆、本山茂直等一行人逃离了瓜生野城后，为了避免夜长梦多，也不再将君仁臣忠的戏继续演下去，直接与本山佐渡介（本山茂定长男）、本山右近将监（本山茂定次男）、秦泉寺扫部助等人悍然对本山茂辰进行发难。
此时的本山茂辰与孤家寡人无异，只能眼睁睁看着本山茂定带着一众凶神恶煞的武士们冲入本丸寝殿之中，将自己架走。就算他连连求饶也无济于事。
等本山茂定完全控制瓜生野城后，就派遣将自己的侄子，同时也是自己的主君本山茂辰送往长宗我部军阵中，以求长宗我部军能够停下进军的脚步，并允许自己继承本山家的家名，在瓜生野城一带苟延残喘、保全家名。
不过，吉良亲贞对本山茂定此举并没有感到任何的高兴，反而是非常厌恶。
再怎么说，本山茂辰不单单是长宗我部元亲的姐夫，更是长宗我部元亲的舅舅。就算长宗我部家与本山家之间有着宿怨，两家还是姻亲关系。而本山茂定这个本山家庶流出身之人可与长宗我部家没有丝毫的血缘关系。
再加上，吉良亲贞认为本山茂定这个本山家同族重臣在本山家危难之际会选择卖主求荣，那么谁能保证将来长宗我部家危难之际，此人还会继续保持忠心？
之后，吉良亲贞假意邀请本山茂定、本山佐渡介、本山右近将监父子前来参加鹰狩，在他们赶来的途中命家臣伪装成盗贼设伏，将他们尽数讨取。
至此，于长冈郡活跃了两百七十余年的本山家作为战国大名在事实上覆灭。本山茂辰也在迁入长宗我部家本据冈丰城城下町后不久郁郁而终。
与此同时，从神森城一路南下逃亡的神森通茂并没有想象中的一帆风顺。当他在投奔曾经交好，且臣从于长宗我部家军门之下的森山城城主富家刑部大辅后，为了不牵连好友，就选择了讨要一艘船只用于渡海前往伊予，准备投奔神森家的总领家河野家。
显然，神森通茂因长期被长宗我部家围攻，以及切断周边联系后，并不知晓此时土佐一国的形势，更不知晓淡路安宅一族在上杉清定的安排下，已护送一条内基下向土佐幡多郡。
要知道，淡路水军众与其他水军众不同。一般的海贼只是劫掠钱财，不会谋财害命。若是在海面上遇到了淡路水军众，那么手无寸铁之人就会被直接下海与龙王作伴了。
尽管安宅信康、安宅贵康兄弟二人率淡路安宅家残部下向土佐幡多郡，并被主君上杉清定要求负责一条内基的安全，以及周边海域的海运畅通，尤其是来自九州方面。
故而，安宅信康、安宅贵康兄弟不敢轻易对有萨摩口音的商船下手，但对那些没有悬挂岛津家、长宗我部家家纹，或是没有萨摩口音船员的船只，他们还是旧习难改。不仅掠走船上一切有价值的东西，就连水手都不放过，尽数丢入海中喂鱼。
当然，安宅信康、安宅贵康兄弟为了掩人耳目，还是伪装成三好家旗下的淡路水军众、盐饱水军众。
人倒霉的时候，喝口凉水都能塞牙。
就在神森通茂所搭乘的富家家商船才驶出土佐湾不久，就遭到了淡路安宅众战船的阻截。
富家刑部大辅本就是实力一般的土佐国人领主，根本无法像实力雄厚的上杉家那样为自家商船配备足够的弓矢、铁炮、焙烙玉等远程武器。
毫无疑问，富家家的商船根本没有还手的能力，甚至连掉头逃跑都做不到。
即便如此，神森通茂并没有向现实低头，他为了复兴主家本山家，可不打算葬身于此。
趁着伪装成三好家旗下盐饱水军众的淡路安宅众通过跳板、荡索等方式纷纷跳帮登上商船之际，神森通茂并没有选择与之交锋，反而是偷偷打开自己所在船舱的舷窗跳入海中。
值得神森通茂庆幸的是，此时的土佐湾周边海域很快就刮来了巨风，并没有让注意到其跳入海中。但他还是被海浪席卷后冲至仁淀川出海口的岸边，被途径于此的西畑城城主山内外记所救。
值得庆幸的是，山内外记与富家刑部大辅一样，皆是原本山家家臣，并出于曾经同袍情谊，便主动出手相助。
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