智慧方舟下方的土壤改良基地内，巨型培养罐如同沉默的钢铁巨兽，表面凝结的水珠顺着冰冷的金属外壳蜿蜒而下。沈括戴着防化面罩，隔着强化玻璃凝视着罐内翻滚的墨绿色液体，那是经过七次基因编辑的“熵解菌2.0”。显微镜下，这些经过改造的微生物正以惊人的速度吞噬着模拟的深渊污染颗粒，鞭毛摆动间，黑色污染物如同被火焰灼烧的残雪，迅速分解成无害的有机物质。
“新版本的熵解菌不仅能分解深渊污染，还能分泌促进植物生长的激素。”沈括的声音透过通讯器传来，带着一丝难掩的兴奋，“但如何让它们在自然环境中稳定繁殖，仍是个难题。”他调出全息投影，翡翠五号星的土壤样本在虚拟空间中缓缓旋转，土壤剖面里，原本活跃的微生物群落被一层诡异的黑色菌丝覆盖，如同大地患上了恶性肿瘤。
阿雷转动着手中的机械齿轮，金属碰撞声清脆而冰冷：“我们可以制造‘生态机器人’，让它们携带熵解菌在土壤中活动，同时监测微生物的生长情况。”在他的指挥下，机械族工匠们日夜赶工。车间里，激光切割器喷射出刺目的红光，将星陨商路带回的神秘合金切割成精密的零件。这些形似甲虫的生态机器人，外壳布满仿生结构的透气孔，腹部的培养舱闪烁着幽蓝的光芒，里面储存着数十亿计的熵解菌。
当第一批生态机器人被投放到翡翠五号星的试验田时，效果立竿见影。原本板结如岩石的土地逐渐变得松软，被深渊污染染成黑色的土壤，以肉眼可见的速度恢复成正常的褐色。监测数据显示，土壤中的重金属含量在三天内下降了67%，而有机质含量开始稳步回升。然而，一周后的清晨，技术员们在田间发现了令人心惊的一幕——数百台生态机器人瘫倒在地，外壳被腐蚀出密密麻麻的孔洞，内部培养舱中的熵解菌失去活性，变成了灰白色的絮状物。
“有未知微生物在与熵解菌竞争资源！”沈括盯着显微镜，瞳孔因震惊而微微收缩。镜头下，一种形似蜘蛛的微型生物正用螯肢刺破熵解菌的细胞壁，吸食里面的营养物质。这些生物通体透明，体内流淌着诡异的紫色液体，每一次进食，身体都会膨胀一圈，随后分裂出两个更小的个体。更糟糕的是，它们能分泌一种特殊的酶，不仅抑制熵解菌的活性，还会加速金属腐蚀。
研究团队立刻展开调查。莉莉丝在数据空间中构建了庞大的生物数据库，通过基因测序比对，发现这种生物的基因片段与深渊污染残留的暗物质高度吻合。“它们不是自然进化的产物，”她的声音带着一丝颤抖，“是深渊力量刻意制造的‘生态武器’！”而此时，试验田中的情况正急剧恶化，蜘蛛状生物以指数级速度繁殖，它们编织的菌丝网络在土壤中蔓延，所到之处，熵解菌全军覆没，连农作物的根系也被啃食得千疮百孔。
阿雷立即改造生态机器人，为它们加装声波发射器。当调整好频率的声波在土壤中传播时，那些蜘蛛状生物纷纷蜷缩起来，失去行动能力。但新的问题接踵而至，过度使用声波导致土壤中的其他有益微生物也受到影响，蚯蚓停止松土，固氮菌不再工作，土地重新陷入板结。“我们就像在使用一把钝刀，杀敌一千自损八百。”阿雷一拳砸在操作台上，金属表面凹陷出一个清晰的拳印。
就在团队陷入绝望时，艾莉拉想起了精灵族的自然魔法。她带领祭司们在试验田周围布置魔法阵，古老的咒语声中，翡翠色的光芒从地下涌出，召唤来一种能与熵解菌共生的“光尘微生物”。这些微生物形如闪烁的星尘，附着在熵解菌表面，形成一层透明的保护膜。神奇的是，蜘蛛状生物似乎对光尘微生物十分忌惮，一旦靠近就会远远避开。在魔法与科技的双重作用下，土壤中的微生物生态终于达到平衡。
随着土壤改良工作的推进，翡翠五号星上开始种植各种农作物。但很快，人们发现部分作物出现了畸形生长的情况。玉米结出的棒子扭曲如麻花，番茄果实表面布满瘤状凸起，而小麦的麦穗则呈现出诡异的紫色。经过检测，原来是土壤中残留的微量深渊污染与新引入的微生物发生了变异反应，产生了一种未知的毒素。
沈括带领团队再次投入研究。实验室里，培养皿中的植物样本在毒素作用下迅速枯萎，而各种化学试剂与生物制剂的组合实验均以失败告终。首到某天深夜，沈括在整理古籍时，偶然发现了一段来自远古文明的记载：“以纯粹之光明，驱散黑暗之影。”他灵光乍现，将数据宇宙的净化程序与精灵族的光明魔法结合，研发出一种“污染中和剂”。这种半透明的胶体物质，能精准吸附土壤中的毒素分子，将其分解成无害的气体。
当第一片健康的麦田在改良后的土地上成熟时，金色的麦浪随风起伏，麦穗沉甸甸地弯下腰。苏小满站在田埂上，金算盘轻轻颤动，算珠表面浮现出全新的符文，那是科技、魔法与自然达成和解的象征。然而，这场胜利并未让她放松警惕。在智慧方舟的阴影处，一双充满恶意的眼睛正注视着这片繁荣的景象，新的危机，正在黑暗中悄然酝酿……
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