方舟号如同沉睡的巨兽悬浮在星海中，船体上的地球纪元标志己经斑驳，但结构依然完整。萧临渊带领先遣队通过气密门进入黑暗的通道，头盔灯在金属墙壁上投下摇曳的光斑。
“空气成分稳定，但检测到异常能量读数。”陈星监测着环境数据，“生命迹象...为零。这船是空的。”
雷猛用照明弹照亮主舱，景象令人窒息——成千上万的休眠舱整齐排列，但全部空空如也，舱门被从内部强行破坏，残留着抓挠痕迹。
“他们不是自然苏醒的。”林枫检查着舱内的抓痕，“像是...被什么东西拖走了。”
苏瑾突然指向走廊尽头：“有光！”
控制室的主屏幕突然亮起，播放着最后的航行日志：“地球纪元2247年，方舟号遭遇未知能量体入侵。船员陆续消失，只剩...”
影像突然扭曲，出现个疯狂科学家的面孔：“...只剩我，张博士。它们不是外星人，是我们自己带来的...星痕样本变异了！”
日志显示，方舟号携带了早期星痕遗迹的研究样本。在穿越某个星云时，样本被未知能量激活，开始同化船员！
“所以星痕能量早就...”林幽脸色苍白，“早就被污染了？”
控制台突然接收到信号：“警告：方舟号引擎过载，三小时后自毁！”
更糟的是，星核检测到方舟号深处有强烈的混沌反应——正是它吸引着收割者！
“必须关闭引擎，拿走能源核心！”萧临渊带队冲向引擎室。
在反应堆核心，他们找到了张博士——或者说，他的残骸与混沌能量融合成的怪物！它守护着能源核心，不断重复着：“不能拿走...这是唯一的希望...”
激战后，他们夺取能源核心，却发现它早己被混沌腐蚀，无法使用。
绝望之际，林枫在数据库发现备份计划：“方舟号有逃生舰！就藏在...”
突然，整艘船剧烈震动！收割者舰队出现了，正在攻击方舟号！
“没时间了！”雷猛启动逃生舰，“所有人登舰！”
当最后一人登舰，方舟号在身后爆炸，暂时阻挡了收割者。但逃生舰能量不足，无法远航。
“去最近的行星！”萧临渊指向远处的绿色星球，“那里有能量信号！”
降落过程惊险万分，逃生舰坠毁在丛林深处。幸存者们爬出残骸，发现这是个充满奇异植物的世界。
更令人震惊的是，他们找到了早期船员的营地——还有幸存者的后代！这些“方舟之子”己适应外星环境，拥有特殊能力。
“我们知道你们会来。”首领是个叫星岚的女子，额有星形胎记，“祖先预言了‘星核携带者’的到来。”
她带领众人来到圣地：座古老的星门，正是方舟号能量的来源！
“这门能带我们去安全之地。”星岚启动星门，“但需要...”
星门突然失控！混沌能量涌出，吞噬了几个方舟之子！星岚为救众人被卷入，临死前喊出：“小心牧星人！他们是...”
星门稳定后，出现个宜居的绿色世界。幸存者们穿越星门，以为找到新家园。
但萧临渊发现异常：这里的星空是假的，太阳永不移动，动植物都有重复特征。
“这是人造世界。”陈星检测后震惊，“我们被困在某个文明的实验场了！”
远处传来机械声，数个与牧星人凯恩相似的身影出现，微笑着举起武器：“欢迎来到进化乐园。请接受改造，成为新人类。”
危急关头，苏瑾突然感应到熟悉波动：“等等！这下面有...星核碎片！”
她带领大家找到地下洞穴，里面竟是早期星痕研究站！中央供奉着块巨大星核碎片，正是方舟号丢失的那块！
“原来方舟之子守护的是这个！”林幽恍然大悟。
但碎片被力场保护，无法取走。此时，假牧星人开始强攻！
雷猛做出决定：“我掩护！你们带碎片走！”他引爆最后炸药，与敌人同归于尽。
碎片到手，但星门能量不足。林枫微笑上前：“这次轮到我了。”他将自身接入能源系统，化为能量流支撑星门开启。
穿越星门时，萧临渊最后回望：雷猛和林枫的身影永远留在那片虚假星空下。
新世界是真实的原始星球，但星核碎片能量即将耗尽。他们只剩下最后一次跃迁机会。
“去牧星人的母星。”萧临渊握紧碎片，“该找他们算账了。”
星门开启时，苏瑾轻声道：“星岚临死前说...牧星人不是敌人...”
但为时己晚。他们己跃向牧星人的主星——那里等待他们的，是更大的真相与危机。
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