清晨，晨雾笼罩城市，边缘的自来水厂似灰白色堡垒，水塔与管道纵横交错，散发着威严又神秘的气息。
叶真真身着便服，眼神坚定果敢。她趁人不注意，敏捷地趴在地上，迅速爬到送水车底盘下，紧紧贴住。工作服口袋里，那微型采样瓶毫不起眼，却承载着揭开秘密的希望。送水车缓缓驶入厂区，叶真真心跳如鼓，她抓着底盘零件保持平衡，留意周围动静。车停稳后，她趁工人忙碌，悄悄钻出，融入人群，目标首指第七净水车间。
车间金属门坚固，装有指纹识别、密码输入和面部识别三重验证装置。叶真真早有准备，从夜班交接表发现每逢17号凌晨，监控会有十五分钟数据断层，她打算利用这段时间进入。
与此同时，林深穿着疾控中心制服，戴眼镜，拿着伪造检测单走向保安亭。保安简单询问后放行。林深进厂区就首奔过滤池，掏出辐射仪扫描，表盘指针疯狂摆动，辐射特征与三线时期拓扑种子残留一致，他顿感事情棘手。路过值班室，墙上先进工作者照片里的员工后颈都贴着医用胶布，这诡异细节让他心生寒意。
陈小飞留下的管网图引导他们来到沉淀池地下室。入口生锈铁门挂着“危化品禁入”牌子，锁芯里钥匙还有体温。叶真真和林深对视一眼，小心推开门，门嘎吱作响。
门开后，叶真真被眼前景象震撼：地下室成排玻璃柱中悬浮着散发神秘光芒的紫色晶体，循环泵将溶液注入输水主管道，“咕噜咕噜”声令人胆寒。林深掏出光谱分析仪扫描溶液，脸色凝重：“不是催化剂，是混合苯乙胺衍生物的记忆增强剂。”他想起父亲实验室里饮水中添加类似化合物后变得暴躁的实验猴。
警报突然尖锐响起，叶真真迅速装满采样瓶，和林深躲进氯气罐存储间。林深在角落发现某制药公司运输清单，显示每月17号有标注“认知矫正剂”的原料送入，签收人竟是己故十年的周维民，这让他们满心困惑。
深夜，市档案馆灯光昏黄。叶真真独坐桌前，用紫外线灯照射1978年供水管网图，所谓抗震加固的红色标记显现出拓扑种子扩散路径，如巨大蜘蛛网般错综复杂。她将陈小飞图纸叠加，惊人发现重合点对应全市中小学饮用水塔坐标，顿感不妙，决定深入调查。
林深潜入教育局退休科，办公室满是泛黄学籍档案。他经长时间查找，发现市级三好学生家庭住址分布在第一代拓扑种子投放管线末端，2015年体检报告显示这些学生家长甲状腺结节检出率高达79%，远超平均水平，他意识到背后可能藏着巨大阴谋。
在污水处理厂，叶真真和林深找到老职工。他醉醺醺、说话含糊，可提到第七车间，眼神瞬间警惕：“每逢暴雨夜，第七车间排水口会流出荧紫色液体，像当年三线厂泄的那些东西。上头派人来查，结果整个调查组都调去扶贫了。”二人闻言，心中寒意顿生，明白有人在掩盖真相。
叶真真冒险穿防护服采集排水口样本，回实验室气相色谱分析。结果显示化合物结构与二代晶体溶液相似度达91%，还有未知蛋白质标记物。公安内网比对时跳出陈小飞失踪前设定的死亡倒计时乱码，她脸色苍白，意识到危险逼近。
林深在旧货市场一家破旧店里淘到原自来水厂长拍卖藏品《1998年防汛日志》，里面夹着周维民亲笔信：“他们要在新纪元来临前完成播种...”信纸背面水渍显影人体拓扑图，消化系统标注点与甲状腺结节分布一致，他满心疑惑恐惧，感觉接近阴谋核心。
暴雨倾盆，叶真真戴防毒面具潜入第七车间。车间弥漫刺鼻化学气味，灯光昏暗闪烁。她在值班室电脑发现自动发送程序，每月17号凌晨注入300升“特殊添加剂”，始于2003年非典，最近升级增加人工智能配比功能，她又惊又怒。
林深专注破解加密供应链系统，成功后发现“认知矫正剂”原料来自境外离岸公司，董事名单有星海市前任市长名字，海关检验单显示货柜夹层藏的是冷冻胚胎，而非化学原料，二人震惊不己，深知阴谋远超想象。
在防空洞整理证据时，叶真真发现所有线索指向六天后的6月17日。林深用拓扑模型推演得出恐怖结论：当天供水量达年度峰值，能让全市92%人口摄入临界剂量三代晶体溶液。“不是改良，是迭代。”叶真真对比样本，脸色惨白，“他们在把人体改造成活体培养皿...”
话音刚落，洞口传来碎石滚落声，三道红外线瞄准点晃在胸口，黑影里传出冰冷警告：“49号协议欢迎志愿观察员。”二人顿感寒意，知道被敌人发现，生死逃亡开始。
逃亡中，林深把证据包扔进运粪车，希望保存证据。叶真真躲进幼儿园校车，在GPS定位器发现恐惧真相：校车每日路线与拓扑种子投放路径重合，车载饮水机滤芯残留婴幼儿安全剂量记忆增强剂，连孩子都成了阴谋受害者。
黎明，林深和叶真真在码头废船汇合，满脸疲惫恐惧，眼神却坚定不屈。陈小飞倒计时牌剩120小时，他们手握证据链足以撼动星海市。叶真真摸着玉佛吊坠，发现母亲照片背面印着749局第三特别行动组编号，满心疑惑。
废船里，二人商量下一步计划。时间紧迫，必须公布证据，又面临危险。“不能坐以待毙，要主动出击。找安全地方整理证据，通过媒体公布。”林深坚定说道，叶真真点头。他们小心翼翼离开废船，在满是阴谋危险的城市，如渺小却有正义之火的星星，坚信坚持就能揭开真相，让黑暗中的人受罚。
然而，他们不知身后有眼睛紧盯，更惊心动魄的较量即将开启……
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